Berdasarkan Buku Induk Kode dan Data Wilayah Administrasi Pemerintahan Per Provinsi, Kabupaten/Kota, Kecamatan, dan Desa/Kelurahan Seluruh Indonesia yang diterbitkan oleh Kementerian Dalam Negeri (Kemendagri, 13 November 2023)
Berikut nama-nama Kecamatan, Desa/Kelurahan, dan kode wilayah administrasi di Kab. Pulau Morotai.
1
Morotai Selatan
82.07.01
9
Sabatai Baru
82.07.01.2009
10
Sabatai Tua
82.07.01.2010
12
Dehegila
82.07.01.2012
14
Galo-Galo
82.07.01.2014
19
Muhajirin
82.07.01.2019
23
Daeo Majiko
82.07.01.2023
24
Morodadi
82.07.01.2024
25
Nakamura
82.07.01.2025
2
Morotai Selatan Barat
82.07.02
3
Ngele-Ngele Kecil
82.07.02.2003
5
Aru Irian
82.07.02.2005
8
Cio Gerong
82.07.02.2008
9
Ngele-ngele Besar
82.07.02.2014
11
Cio Dalam
82.07.02.2016
12
Usbar Pantai
82.07.02.2017
13
Tiley Pantai
82.07.02.2018
14
Cio Maloleo
82.07.02.2019
3
Bere Bere Kecil
82.07.03.2003
4
Titigogoli
82.07.03.2004
10
Podimor Padange
82.07.03.2010
11
Sopi Majiko
82.07.03.2011
1
Bere-bere
82.07.04.2001
10
Loleo Jaya
82.07.04.2010
12
Tanjung Saleh
82.07.04.2012
13
Goa Hira
82.07.04.2013
14
Gorua Selatan
82.07.04.2014
1
Buho-Buho
82.07.05.2001
6
Sambiki Tua
82.07.05.2006
8
Sambiki Baru
82.07.05.2008
9
Sangowo Barat
82.07.05.2009
10
Sangowo Timur
82.07.05.2010
11
Seseli Jaya
82.07.05.2011
13
Gosoma Maluku
82.07.05.2013
15
Doku Mira
82.07.05.2015
1
Posi-Posi
82.07.06.2001
2
Aru Burung
82.07.06.2002
3
Lou Madoro
82.07.06.2003
5
Sami Nyamau
82.07.06.2005
Jumlah Kecamatan: 6 | Total Desa/Kelurahan: 88