Berdasarkan Buku Induk Kode dan Data Wilayah Administrasi Pemerintahan Per Provinsi, Kabupaten/Kota, Kecamatan, dan Desa/Kelurahan Seluruh Indonesia yang diterbitkan oleh Kementerian Dalam Negeri (Kemendagri, 13 November 2023)
Berikut nama-nama Kecamatan, Desa/Kelurahan, dan kode wilayah administrasi di Kab. Raja Ampat.
1
Misool (Misool Utara)
96.05.01
3
Waigeo Selatan
96.05.03
2
Saporkren
96.05.03.2014
4
Salawati Utara
96.05.04
3
Jefman Barat
96.05.04.2003
5
Jefman Timur
96.05.04.2016
5
Kepulauan Ayau
96.05.05
5
Yenkanfan
96.05.05.2008
3
Usaha Jaya
96.05.06.2011
4
Limalas Timur
96.05.06.2012
6
Limalas Barat
96.05.06.2017
2
Yenbekaki
96.05.08.2002
3
Urbinasopen
96.05.08.2003
9
Teluk Mayalibit
96.05.09
2
Warsamdin
96.05.09.2007
1
Yenbekwan
96.05.11.2001
2
Kapisawar
96.05.11.2002
3
Sawinggrai
96.05.11.2003
4
Yenwaupnor
96.05.11.2004
9
Sawandarek
96.05.11.2009
12
Misool Selatan
96.05.13
3
Harapan Jaya
96.05.13.2007
4
Usaha Jaya
96.05.13.2009
14
Waigeo Barat Kepulauan
96.05.15
1
Manyaifun
96.05.15.2001
2
Meosmanggara
96.05.15.2002
16
Kepulauan Sembilan
96.05.17
1
Wejim Barat
96.05.17.2001
2
Wejim Timur
96.05.17.2002
3
Satukurano
96.05.17.2003
4
Pulau Tikus
96.05.17.2004
2
Sapordanco
96.05.18.1002
18
Tiplol Mayalibit
96.05.19
19
Batanta Utara
96.05.20
1
Yensawai Timur
96.05.20.2001
2
Yensawai Barat
96.05.20.2002
3
Arefi Timur
96.05.20.2003
4
Arefi Selatan
96.05.20.2004
20
Salawati Barat
96.05.21
21
Salawati Tengah
96.05.22
4
Meosbekwan
96.05.24.2004
24
Batanta Selatan
96.05.25
Jumlah Kecamatan: 24 | Total Desa/Kelurahan: 121